Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEAL3Q969E4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TCEAL3Q969E4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms