Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
P3H4Q92791 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
P3H4Q92791 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
P3H4Q92791 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms