Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX1Q92499 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX1Q92499 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX1Q92499 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX1Q92499 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX1Q92499 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX1Q92499 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX1Q92499 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX1Q92499 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms