Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC12Q8WVT3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC12Q8WVT3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms