Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD1

RAB2B, Ras-related protein Rab-2B, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2BQ8WUD1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB2BQ8WUD1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB2BQ8WUD1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB2BQ8WUD1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB2BQ8WUD1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB2BQ8WUD1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB2BQ8WUD1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB2BQ8WUD1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB2BQ8WUD1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB2BQ8WUD1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms