Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF398Q8TD17 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF398Q8TD17 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF398Q8TD17 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.2 ms