Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEDD1Q8NHV4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD1Q8NHV4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms