Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HELBQ8NG08 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HELBQ8NG08 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HELBQ8NG08 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms