Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC197Q8NCU1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC197Q8NCU1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms