Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATAD1Q8NBU5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAD1Q8NBU5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms