Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMYD1Q8NB12 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMYD1Q8NB12 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms