Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNPLA1Q8N8W4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNPLA1Q8N8W4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNPLA1Q8N8W4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms