Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBR7Q8N806 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBR7Q8N806 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBR7Q8N806 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms