Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC155Q8N6L0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC155Q8N6L0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC155Q8N6L0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms