Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms