Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC33Q8N5R6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC33Q8N5R6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC33Q8N5R6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms