Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SFRP1Q8N474 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SFRP1Q8N474 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFRP1Q8N474 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms