Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SYCE1Q8N0S2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SYCE1Q8N0S2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SYCE1Q8N0S2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms