Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFT20Q8IY31 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT20Q8IY31 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFT20Q8IY31 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFT20Q8IY31 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT20Q8IY31 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT20Q8IY31 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT20Q8IY31 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT20Q8IY31 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms