Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXS2

CCDC65, Coiled-coil domain-containing protein 65, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC65Q8IXS2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC65Q8IXS2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC65Q8IXS2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC65Q8IXS2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC65Q8IXS2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC65Q8IXS2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC65Q8IXS2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC65Q8IXS2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC65Q8IXS2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC65Q8IXS2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC65Q8IXS2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC65Q8IXS2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC65Q8IXS2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC65Q8IXS2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC65Q8IXS2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC65Q8IXS2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC65Q8IXS2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC65Q8IXS2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC65Q8IXS2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms