Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RHOT1Q8IXI2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RHOT1Q8IXI2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms