Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLF2Q8IX21 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLF2Q8IX21 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLF2Q8IX21 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms