Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VSTM4Q8IW00 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM4Q8IW00 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms