Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KSR1Q8IVT5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KSR1Q8IVT5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KSR1Q8IVT5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms