Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCA5Q86VQ0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LCA5Q86VQ0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms