Protein–RNA interactions for Protein: Q86V40

TRABD2A, Metalloprotease TIKI1, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2AQ86V40 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRABD2AQ86V40 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRABD2AQ86V40 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms