Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
N4BP2Q86UW6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
N4BP2Q86UW6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
N4BP2Q86UW6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms