Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PBRM1Q86U86 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PBRM1Q86U86 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PBRM1Q86U86 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PBRM1Q86U86 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PBRM1Q86U86 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
PBRM1Q86U86 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
PBRM1Q86U86 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PBRM1Q86U86 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PBRM1Q86U86 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
PBRM1Q86U86 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PBRM1Q86U86 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PBRM1Q86U86 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PBRM1Q86U86 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PBRM1Q86U86 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PBRM1Q86U86 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
PBRM1Q86U86 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PBRM1Q86U86 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PBRM1Q86U86 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PBRM1Q86U86 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PBRM1Q86U86 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC37.88■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
PBRM1Q86U86 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PBRM1Q86U86 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PBRM1Q86U86 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms