Protein–RNA interactions for Protein: Q86U17

SERPINA11, Serpin A11, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA11Q86U17 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINA11Q86U17 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINA11Q86U17 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms