Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCGF5Q86SE9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCGF5Q86SE9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms