Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
NPM2Q86SE8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
NPM2Q86SE8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NPM2Q86SE8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NPM2Q86SE8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NPM2Q86SE8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NPM2Q86SE8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NPM2Q86SE8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NPM2Q86SE8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NPM2Q86SE8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NPM2Q86SE8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NPM2Q86SE8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NPM2Q86SE8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NPM2Q86SE8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NPM2Q86SE8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NPM2Q86SE8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NPM2Q86SE8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NPM2Q86SE8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NPM2Q86SE8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NPM2Q86SE8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NPM2Q86SE8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NPM2Q86SE8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NPM2Q86SE8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms