Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLNKQ7Z7G1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLNKQ7Z7G1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms