Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRAPQ7Z569 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRAPQ7Z569 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRAPQ7Z569 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms