Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTY1

SLC16A9, Monocarboxylate transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A9Q7RTY1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SLC16A9Q7RTY1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC16A9Q7RTY1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC16A9Q7RTY1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC16A9Q7RTY1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC16A9Q7RTY1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC16A9Q7RTY1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms