Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LPCAT2Q7L5N7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LPCAT2Q7L5N7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms