Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SV2BQ7L1I2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SV2BQ7L1I2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.4 ms