Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RUFY3Q7L099 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RUFY3Q7L099 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUFY3Q7L099 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms