Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
PREX2Q70Z35 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PREX2Q70Z35 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PREX2Q70Z35 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PREX2Q70Z35 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PREX2Q70Z35 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PREX2Q70Z35 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PREX2Q70Z35 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms