Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP47Q6ZTR5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP47Q6ZTR5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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