Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00299Q6ZSB3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00299Q6ZSB3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00299Q6ZSB3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms