Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLCO4C1Q6ZQN7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLCO4C1Q6ZQN7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms