Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAF7Q6Q0C0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAF7Q6Q0C0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAF7Q6Q0C0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms