Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CASC4Q6P4E1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CASC4Q6P4E1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms