Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEPROQ6NW34 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEPROQ6NW34 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEPROQ6NW34 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms