Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
REP15Q6BDI9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REP15Q6BDI9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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