Protein–RNA interactions for Protein: Q68D42

TMEM215, Transmembrane protein 215, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM215Q68D42 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM215Q68D42 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM215Q68D42 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM215Q68D42 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM215Q68D42 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM215Q68D42 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM215Q68D42 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM215Q68D42 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM215Q68D42 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM215Q68D42 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM215Q68D42 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM215Q68D42 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM215Q68D42 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM215Q68D42 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM215Q68D42 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM215Q68D42 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM215Q68D42 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms