Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CREB3L3Q68CJ9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CREB3L3Q68CJ9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms