Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LARP1BQ659C4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP1BQ659C4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms