Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DENND4CQ5VZ89 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DENND4CQ5VZ89 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND4CQ5VZ89 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms