Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYY2

LIPM, Lipase member M, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPMQ5VYY2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIPMQ5VYY2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIPMQ5VYY2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms