Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAMD13Q5VXD3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SAMD13Q5VXD3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms